La technologie d’ultrafiltration peut être utilisée pour la séparation et la purification des médicaments, l’élimination des pyrogènes et la stérilisation, en particulier pour la séparation et l’extraction des antibiotiques et des vitamines. Certains chercheurs ont proposé une méthode d'ultrafiltration/extraction qui résout fondamentalement le problème de l'émulsification dans l'extraction des antibiotiques, améliorant ainsi le rendement de l'extraction et la qualité du produit.
Actuellement, l’adsorption sur charbon actif est couramment utilisée pour éliminer les pyrogènes lors de la préparation des injections de ginsénoside. Cette méthode présente des inconvénients tels qu'une perte importante de saponines totales et des coûts de production élevés. L’ultrafiltration, quant à elle, élimine efficacement les pyrogènes lors de la préparation des injections de ginsénosides, tout en réduisant également la perte de ginsénosides totaux. C’est simple, fiable et efficace. La technologie d'ultrafiltration a également été utilisée pour éliminer les endotoxines bactériennes générées lors de la production du vaccin antirabique, ce qui entraîne moins de perte d'antigène et d'enrichissement des échantillons, répondant ainsi aux exigences de production de vaccin.